Õpilasnõustaja põhitöö koolis on õpilaste abistamine nende käitumise, suhtlemise, õppimise ning muude probleemide korral. Õpilasnõustaja tegeleb peamiselt õpilastega, aga ka õpetajate ja lapsevanematega.
Õpilasnõustaja töökohustused on näiteks:
õpilaste probleemide välja selgitamine (testimine, vaatlemine, vestlemine); õpilaste nõustamine (kuulamine, toetamine, suunamine jms); õpetajate ja lastevanemate nõustamine ning nende omavahelise koostöö edendamine; koostöö juhtkonnaga, et koolis oleks hea töökeskkond.
Olenevalt olukorrast võib tekkida vajadus teha koostööd ka teiste spetsialistidega (sotsiaaltöötaja, lastekaitse esindaja, psühhiaater, valla töötajad, kooli meditsiini töötaja jt.). Kõige olulisem on, et laps saaks temale vajaliku abi.